Департамент анализа данных и искусственного интеллекта
Скачать 0.63 Mb.
|
2. Информационный анализ электрокардиосигналов. Все знают, что по электрокардиограмме можно ставить диагнозы сердечно-сосудистых заболеваний. Профессором д.м.н. В.М.Успенским предложен новый метод диагностики, позволяющий диагностировать широкий спектр заболеваний внутренних органов по ЭКГ. Многие болезни сказываются на работе сердца задолго до проявления клинических симптомов, что позволяет использовать ЭКГ для ранней диагностики. За 15 лет применения этой технологии накоплена обучающая выборка по двадцати тысячам больных и нескольким десяткам заболеваний. Вычислительные эксперименты подтверждают, что диагностика широкого спектра заболеваний по одной ЭКГ с использованием методов машинного обучения может достигать удивительной точности. Наша научная группа занимается всесторонней статистической экспертизой этого метода диагностики и разработкой новых принципов анализа дискретизированных биомедицинских сигналов. В частности, важным направлением является применение тематического моделирования и методов компьютерной лингвистики. Фактически, речь идёт о поиске оптимальной реконструкции (восстановлении синтаксиса и семантики) языка, порождаемого протекающими в организме человека сложнейшими физиологическими процессами, и при этом несущего значимую диагностическую информацию о состоянии здоровья человека. Основные направления исследований и разработкок:
Ройтберг Михаил Абрамович 1. Исследование структурных мотивов РНК: H-узлы RNA structural motifs: H-knots Предлагается провести сравнительный анализ H-узлов, содержащихся в экспериментально определенных пространственных структурах РНК, выявить общие закономерности их строения, а также предложить объяснение найденных закономерностей. Кроме того, предлагается изучить взаимосоответствие между H-узлами и третичными мотивами вида A-minor. Пространственная структура РНК играет ключевую роль в различных внутриклеточных процессах, протекающих с участием РНК. При этом, в отличие от белков, типичные мотивы пространственной структуры РНК не систематизированы и, как следствие, недостаточно изучены. Прежде всего это относится к структурным мотивам, образованным с участием не Уотсон-Криковских взаимодействий (т.н. «неканонические структуры»). ===== 2. Исследование структурных мотивов РНК: тройные взаимодействия нуклеотидов RNA structural motifs: triple interactions of nucleotides Предлагается провести сравнительный анализ одиночных триплетов, содержащихся в экспериментально определенных пространственных структурах РНК и разработать их классификацию, являющуюся обобщением существующей классификации триплетов во внутренних петлях. Также, предлагается интегрировать полученные результаты в базу данных URS. Пространственная структура РНК играет ключевую роль в различных внутриклеточных процессах, протекающих с участием РНК. При этом, в отличие от белков, типичные мотивы пространственной структуры РНК не систематизированы и, как следствие, недостаточно изучены. Прежде всего это относится к структурным мотивам, образованным с участием не Уотсон-Криковских взаимодействий (т.н. «неканонические структуры»). Целью работы является выделение в известных пространственных структурах типичных (многократно встречающихся) неканонических структурных мотивов, разработка методик систематизации, классификации и поиска этих мотивов, изучение их роли в функционировании РНК, в частности, при образовании РНК-белковых контактов, изучение эволюции этих мотивов. Основным инструментарием при выполнении работы будет аннотированная общедоступная база пространственных структур РНК URS, (Universe of RNA Structures), которая доступна по адресу http://server3.lpm.org.ru/urs/), а также алгоритмы сравнительного анализа биополимеров. ======= 3. Исследование структурных мотивов РНК: стекинг оснований RNA structural motifs: base-stacking Предлагается детально изучить стекинг оснований в экспериментально определенных структурах РНК, в частности стекинг оснований в однонитевых участках. Предлагается верифицировать алгоритмы разметки стекинга, интегрировать разметку стекинга в базу данных URS, а также разработать функциональную классификацию стопок стекинга в однонитевых участках. Кроме того, предлагается провести отдельное исследование стекинга в двойных спиралях, образованных неканоническими спариваниями оснований. Пространственная структура РНК играет ключевую роль в различных внутриклеточных процессах, протекающих с участием РНК. При этом, в отличие от белков, типичные мотивы пространственной структуры РНК не систематизированы и, как следствие, недостаточно изучены. Прежде всего это относится к структурным мотивам, образованным с участием не Уотсон-Криковских взаимодействий (т.н. «неканонические структуры»). Целью работы является выделение в известных пространственных структурах типичных (многократно встречающихся) неканонических структурных мотивов, разработка методик систематизации, классификации и поиска этих мотивов, изучение их роли в функционировании РНК, в частности, при образовании РНК-белковых контактов, изучение эволюции этих мотивов. Основным инструментарием при выполнении работы будет аннотированная общедоступная база пространственных структур РНК URS, (Universe of RNA Structures), которая доступна по адресу http://server3.lpm.org.ru/urs/), а также алгоритмы сравнительного анализа биополимеров. ======= 4. Исследование структурных мотивов РНК: Мульти-петли RNA structural motifs: Multiple Junctions Предлагается произвести кластеризацию мульти-петель, содержащихся в экспериментально определенных структурах РНК. При кластеризации будет учитываться стекинг оснований, а также угловые конформации нуклеотидов. Такая кластеризация на данный момент отсутствует. Результаты работы будут интегрированы в базу данных URS. Пространственная структура РНК играет ключевую роль в различных внутриклеточных процессах, протекающих с участием РНК. При этом, в отличие от белков, типичные мотивы пространственной структуры РНК не систематизированы и, как следствие, недостаточно изучены. Прежде всего это относится к структурным мотивам, образованным с участием не Уотсон-Криковских взаимодействий (т.н. «неканонические структуры»). Целью работы является выделение в известных пространственных структурах типичных (многократно встречающихся) неканонических структурных мотивов, разработка методик систематизации, классификации и поиска этих мотивов, изучение их роли в функционировании РНК, в частности, при образовании РНК-белковых контактов, изучение эволюции этих мотивов. Основным инструментарием при выполнении работы будет аннотированная общедоступная база пространственных структур РНК URS, (Universe of RNA Structures), которая доступна по адресу http://server3.lpm.org.ru/urs/), а также алгоритмы сравнительного анализа биополимеров. ======= 5. Исследование структурных мотивов РНК: неизбыточный список структур банка PDB. RNA structural motifs: Non-redundant PDB list Банк экспериментально определенных структур PDB содержит значительное количество повторов. Предлагается составить неизбыточный список структур РНК. Такой список будет построен исходя из гомологичных последовательностей РНК, а также учитывая особенности их пространственных структур. Пространственная структура РНК играет ключевую роль в различных внутриклеточных процессах, протекающих с участием РНК. При этом, в отличие от белков, типичные мотивы пространственной структуры РНК не систематизированы и, как следствие, недостаточно изучены. Прежде всего это относится к структурным мотивам, образованным с участием не Уотсон-Криковских взаимодействий (т.н. «неканонические структуры»). |
Похожие:
 | В большой степени развитию этой дисциплины способствовало проникновение в сферу анализа данных идей, возникших в теории искусственного... |  | Основные исследования, которые ведутся в области искусственного интеллекта. Понятие и структура интеллектуальной системы 2 |
| Инструкции dax вычисляются для находящегося в памяти хранилища реляционных данных, состоящего из таблиц и связей в книге PowerPivot.... | | Существует ли интеллект как психическая реальность? (причины кризиса тестологических теорий интеллекта) |
| Рик Бриггс назвал санскрит идеально пригодным языком для изучения проблем искусственного интеллекта: не утратив своей выразительности,... | | Федерального закона от 21 ноября 2011 г. N 323-фз "Об основах охраны здоровья граждан в Российской Федерации" настоящим подтверждаю... |
| Целью данной работы является изучение основных статистических методов анализа и интерпретации экспериментальных (случайных) данных... | | Эта идея единства структур способностей послужила основой многих интеллектуально-профессиональных тестов, в частности, теста структуры... |
| Эта идея единства структур способностей послужила основой многих интеллектуально-профессиональных тестов, в частности, теста структуры... | | Методы в зависимости от типа социологических исследований подразделяются на качественные и количественные, а в зависимости от этапа... |